每个人的DNA遗传物质都是一半来自母亲，一半来自父亲；因此孩子的一对等位基因也就是一个来自母亲，一个来自父亲。如果对多对等位基因进行检测，鉴定结果如果全部符合这一规律，则表明具有生物学意义上的亲子关系；若不符合这一规律，则排除亲生关系(变异情况除外)。在大多数的情况下，母、子关系是已知的，要求鉴定假设父和孩子是否具有亲生关系。此时只要对比孩子与假设父的基因型，如果每一对等位基因中孩子与假设父都出现相同的基因型，则可以认定具有亲子关系。如果等位基因中孩子与假设父出现两对或两对以上的不匹配的基因型，则可排除假设父与孩子的亲生关系。通常通过13对、15对甚至更多对这样的STR基因位点检测，可以达到认定是否具有生物学意义上的亲子关系。
DNA亲子鉴定目前在社会上已经是一项很成熟的技术了，DNA亲子鉴定是目前最准确的亲权鉴定方法，在单亲的DNA亲子鉴定中，如果小孩的遗传位点和被测试男子的位点有3个以上包括3个的基因位点不一致，那么该男子便100%被排除血缘关系之外，即他绝对不可能是孩子的父亲。如果孩子与其父母亲的位点都吻合，我们就能得出亲权关系大于99.99%的可能性，即证明他们之间的血缘亲子关系，如果出现两个或一个基因位点不一致的话，就可能出现了百分之1.4基因突变的情况，那时就需要补充母亲的样本再进行验证了。
一、DNA亲子鉴定的原理
通俗地讲，一个个体的DNA从父母处获得，而且也只能从父母处获得，其中父母的机会均等，父亲将自己的DNA奉献给孩子一半，母亲也给了一半，孩子各带有父母一半的DIA，孩子不可能带有父母没有的DNA，这是基本的遗传规律。DNA鉴定就是根据这种遗传规律，对父亲、母亲、孩子的DNA进行检测，如果发现孩子带有父亲或者母亲没有的DNA，则可以排除亲子关系，如果经检测孩子确实带有一半父亲、一半母亲的DNA，然后再进行一些统计学方面的计算，以排除大规模人群中非父母子关系偶然出现的DNA一致的情况，最终确定父母子关系。
二、DNA亲子鉴定的样本检测步骤
这里我们选择毛细管电泳仪和荧光标记试剂盒检测进行介绍。从获得样本以后开始，常规样本的检测步骤如下：
第一步:DNA提取
就是把样本细胞核中所含有的DNA提取出来，然后进行一定的纯化，去除样本中的杂质。
第二步:PCR扩增
PCR的中文名为聚合酶链式反应，简单的说，PCR扩增这一步就是把我们所需要的片段通过酶促反应，放大到通过某些专用仪器可以看到的程度。
第三步:后PCR反应
这一步主要是上测序仪检测的准备阶段，将双链的DNA打开，加一些检测用的的内标，主要是用来标记检测的片段长度。
第四步：毛细管测序仪检测
由于DNA带有电荷，通过毛细管电泳的方法，不同片段DNA长度的电泳速度不同，在同样的电压，同样的电泳时间下，泳动的距离不同，这些长短不同的距离可以通过前期加入的内标测量分辨出来，同时可通过一定的软件显示在电脑上，方便检测人员处理和分析数据。
第五步：分析数据，出具报告
主要是检测人员将所得结果进行分析汇总、计算，然后出鉴定结论和报告。DNA鉴定中心司法鉴定所的专家告诉我们，上面的步骤为常规样本(血液、血痕、口腔拭子、带毛囊的毛发)的常规检测步骤，不包含一些特殊样本的前期处理。比如骨骼、牙齿、精斑、混合斑等样本，还需要一个复杂的前期处理过程，有的还需要二次消化，比常规检测的步骤要多很多，而且操作相对精细和麻烦。
